Análise Funcional do Genôma da Cana-de-açúcar
Vagas para:
Doutorado em Bioquímica
Doutorado em Bioinformática
Pós-doutorado
Para candidatos interessados nas linhas de pesquisa abaixo e com experiência em Biologia Molecular, Computação ou Bioquímica e Biologia Celular de Plantas
Análise de Transcriptoma, análise de Redes Regulatórias e Bancos de Dados de sequência e expressão em gramíneas
Análise Funcional de Fatores de Transcrição e Promotores
Quinoma da Cana-de-açúcar: Proteínas Quinases e Proteínas Fosfatases associadas a tratos agronômicos de interesse
Geração e caracterização de plantas transgênicas
Para
informações adicionais consulte:
http://sucest-fun.org
Rocha, F.R., Papini-Terzi,
F.S., Nishiyama-Jr, M.Y., Vêncio, R.Z.N., Vicentini, R., Duarte,
R.D.C., Rosa-Jr, V.E., Vinagre, F., Barsalobres, C., Medeiros, A.H.,
Rodrigues, F.A., Ulian, E.C., Zingaretti, S.M., Galbiatti, J.A., Almeida,
R.S., Figueira, A.V.O., Hemerly, A.S., Silva-Filho, M.C., Menossi, M.
and Souza, G.M. Signal transduction-related responses to phytohormones
and environmental challenges in sugarcane. (2007). BMC Genomics 8, 71.
Flávia Stal Papini-Terzi, Flâvia Riso Rocha, Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio, Kátia Cristina Oliveira, Juliana de Maria Felix, Renato Vicentini, Cristiane de Souza Rocha, Ana Carolina Quirino Simões, Eugênio Cêsar Ulian, Sônia Marli Zingaretti di Mauro, Aline Maria Da Silva, Carlos Alberto de Bragança Pereira, Marcelo Menossi, and Gláucia Mendes Souza . (2005). Transcription Profiling of Signal Transduction-Related Genes in Sugarcane Tissues. DNA RESEARCH 12, 27 - 38.
Vettore, A. L., da Silva, F. R., Kemper, E. L., Souza, G. M. et al. Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for the tropical crop sugarcane. Genome Res. (2003). 13:2725-35.
Souza, G. M., Simoes, A. C. Q. Oliveira, K. C., Garay, H. M., Fiorini, L. C., Gomes, F. S., Nishiyama-Junior, M. Y. and da Silva, A. M. (2001). The sugarcane signal transduction (SUCAST) catalogue: prospecting signal transduction in sugarcane. Genetics and Molecular Biology 24, 25-34.
Souza, G. M. & da Silva, A. M. (2002). SUCAST: desvendando as vias
de transdução de sinal da cana-de-açúcar.
Biotecnologia Ciência e Desenvolvimento 25, 58-63.
PROJETO SUCAST - O nosso grupo realizou uma prospecção dos dados gerados no projeto de sequenciamento do genôma da cana-de-açúcar (SUCEST) com a intenção de identificar Fatores de Transcrição e componentes de Transdução de Sinal e criou um catálogo de módulos conservados e dados de expressão nos diferentes órgãos da planta.Foram também selecionados genes relacionados ao crescimento, desenvolvimento, síntese de fitohôrmonios, patogênese e resposta a estresses bióticos (ataques de pragas e doenças) e abióticos (seca, frio/calor, deficiência nutricional do solo, etc). Estes elementos foram analisados através da tecnologia de microarrays de cDNA em busca de genes associados ao teor de sacarose e envolvidos na resposta a fitôrmonios (ABA e MeJA), seca, interação com bactérias endofiticas, deficiência em fosfato e herbivoria. Os genes identificados e seus promotores estão sendo analisados através da geração de plantas transgênicas utilizando-se a tecnologias de RNAi, antisense e super-expressão. Pretendemos assim identificar genes de interesse agronômico e estudar os mecanismos moleculares regulados durante o desenvolvimento da cana e por alterações ambientais.
PROJETO SUCAMET - A cana-de-açúcar é uma gramínea notável pela sua capacidade de acumular altas concentrações de sacarose nos colmos. O açúcar e o álcool produzidos a partir da cana estão entre os maiores produtos de exportação do país e têm nos últimos anos se tornado um produto estratégico por representar uma fonte de energia renovável. Com o objetivo de investigarmos as rotas metabólicas que contribuem para o alto teor de sacarose da cana-de-açúcar e identificarmos os elementos que regulam o fluxo de carbonos nos órgãos responsáveis pela síntese e acúmulo deste carboidrato criamos um banco de dados contendo genes associados ao metabolismo geral da cana. Estes genes foram analisados quanto ao seu perfil de expressão em plantas durante duas safras em variedades contrastantes para acúmulo de sacarose (brix). Os genes identificados como diferencialmente expressos estão tendo a sua expressão alterada através da geração de plantas transgênicas. A análise bioquímica de alterações metabólicas ao lado da engenharia genética devem nos prover de ferramentas valiosas para a geração de novos cultivares com teor aumentado de sacarose aumentando a produtividade em açúcar e biomassa da cana.
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